12月30日，我院组织开展了一场以“TCGA及GEO数据库简介及分析策略”为题的学术讲座。此次讲座由贵州省人民医院宋具昆博士主讲，全院青年医（教）师以及研究生参会学习。研究生科研管理科副科长谭旭主持讲座。
讲座中，宋具昆从多年来自己撰写高质量论文的经历中总结经验，向参会人员介绍了“The Cancer Genome Altas 数据库（TCGA数据库）”“Gene Expression Omnibus 数据库（GEO数据库）”及其使用教程和操作系统等方面内容。讲座真实生动、贴合基础研究与临床需求，适合我院实际情况。参会教师、医务人员和各年级研究生反响良好，尤其是讲座中详细介绍了数据库对科研研究的重要作用，使研究生和我院教职工受益匪浅。
此次讲座扩大了参会人员眼界，开阔了他们的科研思维，也给临床研究提供了一种新思路。讲座结束后，宋具昆博士逐一回答了大家提出的问题，与我院青年医（教）师及研究生进行了面对面交流，对我院科研发展起到了积极作用。
延伸阅读
宋具昆，男，博士研究生，副主任医师，硕士研究生导师。2003年毕业于遵义医学院口腔医学系，2006年研究生毕业于四川大学华西欧洲杯正规下单平台口腔颌面外科专业，后进入贵州省人民医院口腔科工作，一直从事口腔颌面外科临床工作，并于2013年晋升副主任医师。熟悉循证医学、生物信息学、临床预测模型、影像组学及单细胞、空间转录组学等，对很多公共数据库如seer数据库、Nhanes数据库及Mimic重症医学数据库挖掘有一定的造诣，能熟练应用R软件、stata软件、endnote软件、Cytoscape软件及SPSS等软件进行各种meta分析，如剂量反应的meta分析、基因多态性的meta分析及网络meta分析；能从TCGA、GEO和GTEx芯片数据库下载基因芯片数据，用R语言做差异分析，绘制火山图、热图；能熟练应用高级生物信息学方法如WGCNA及风险模型建立（risk model），用R语言做GO及KEGG分析以及用R语言做生存分析，绘制nomogran图及lasso回归筛选重要变量；能做竞争风险模型及PSM评分，初步了解机器学习方法如随机森林，神经网络等方法。以第一作者及通讯作者发表SCI文章30篇，累计影响因子70分左右，中文核心期刊3篇，参与国自然课题一项，主持贵州科技厅基础项目1项，贵州省卫建委项目1项。
来源 | 研究生科研管理科
作者 | 吴海军
编辑 | 姜文文
排版 | 姜文文
一审 | 廖 健
二审 | 唐正龙
三审 | 宣传科
四审 | 张军梅
